Эндомикоз. Ко времени созревания плодов облепихи в конце июля — начале августа среди ярко окрашенных плодов появляются побелевшие. Больные плоды вначале обесцвечиваются пятнами, затем полностью и становятся дряблыми. Они теряют приятный специфический запах и вкус, присущий здоровым плодам. Содержимое плодов ослизняется, при срывании они раздавливаются и сок растекается по побегу. При рассмотрении под микроскопом под оболочкой заболевших плодов и вокруг семенной камеры виден хорошо развитый мицелий, выделяющий в мякоть плода большое количество одноклеточных почкующихся бластоспор. Масса плодов уменьшается вдвое и они становятся непригодными к использованию.
Установлено два типа поражения плодов облепихи при эндомикозе. Первый, когда плоды облепихи, заболевшие эндомикозом, в конечной стадии заболевания лопаются и содержимое их вытекает. При втором типе больные плоды в конечной стадии заболевания мумифицируются. Садоводы-любители в европейской части РОССИИ в основном разводят алтайские сорта облепихи. Плоды растений, заболевших эндомикозом, лопаются. На остатках оболочек у основания плодоножки гриб зимует, покрывшись плотной черной оболочкой. Весной хламидоспоры образуют новые бластоспоры, которые заражают плоды облепихи. Установлено, что споры гриба проникают в завязь во время выдвижения рыльца пестика, пока цветок остается открытым. В июле активнее заражаются плоды с механическими повреждениями кожицы, в частности нанесенными тлями. В цельный, закрытый плод гриб проникнуть не может.
Меры борьбы: на промышленных плантациях рекомендуют облепиху опрыскивать весной (до распускания почек) нитрофеном 3%-ной концентрации или же 4%-ной бордоской жидкостью. Решающее значение имеет защитная обработка завязей сразу после цветения купрозаном в концентрации 0,4%-ной или 1%-ной бордоской жидкостью. Наиболее легко и массово поражаются плоды сорта Новость Алтая как в Алтайском крае, так и в Нечерноземной зоне.
Садоводам-любителям можно посоветовать заболевшие побелевшие плоды с липким соком срывать для предохранения от заражения других плодов. При значительном наличии таких плодов на ветках следует срезать их вместе с плодами и сжигать.
Парша. В середине лета на листьях, побегах, а затем и на плодах появляются бугорчатые темно-бурые пятна, постепенно переходящие в черную блестящую окраску. Внешний вид кустов, пораженных паршой, весьма характерен: листья, ветви и плоды как бы забрызганы черной тушью, плоды мумифицируются и засыхают, листья на концах ветвей скручиваются и желтеют. На первой стадии заболевания в конце июля на листьях развиваются черные бархатные пятна неправильной формы, расположенные вдоль жилок листа: Под кутикулой листа между клетками растет бурый мицелий гриба, который затем ответвляет конидиеносцы, одиноко или пучками прорастающие через эпидермис листа. В конце августа на плодах появляются округлые лучистые серые пятна, иногда по нескольку на одном плоде. Пятна обусловлены развитием бурого мицелия под кожицей плода. Пораженные плоды сморщиваются и усыхают.
Заболевания значительно сокращают урожай плодов. Кусты, пораженные паршой, теряют до 50% урожая, плохо плодоносят в следующем году, затем усыхают. Парша облепихи в значительной степени распространена в Бурятской и Тувинской АССР и в Горном Алтае. Может быть завезена с посадочным материалом и в Нечерноземную зону. Меры борьбы с паршой не разработаны.