После опыления и затем оплодотворения семяпочка превращается в семя, а завязь и гипантий — в плод. Окраска семян от серовато-бурой до темно-коричневой, почти черной. Зависит она от различного содержания дубильных веществ и темноокрашенных пигментов в семенных покровах. Семена блестящие, имеют продольную борозду (шов) по брюшной стороне семенной кожуры. Их длина достигает 4—7 мм, ширина 2,5—3,5 мм и толщина 1,6—2,2 мм. Абсолютная масса 1000 семян в воздушно-сухом состоянии 14—19 г. По форме они продолговато-округлые, в поперечном сечении эллипсовидные. Зародыш находится в плотной кожистой семенной кожуре сложного анатомического строения. Структура кожуры типична для рода и даже всего семейства, поэтому ее используют в качестве надежного таксономического признака.
Семенная кожура у семян облепихи выполняет, вероятно, защитные функции, ее поверхность гладкая и блестящая. С внешней стороны она окружена мощным кутикулярным слоем, под которым расположены почти квадратные клетки верхнего эпидермиса (рис. 4). Вплотную к клеткам верхнего эпидермиса примыкают столбчатые клетки палисадного однослойного эпидермиса. Эти радиально расположенные клетки плотно сомкнуты между собой, как и клетки верхнего эпидермиса, не имеют межклеточных пространств, они сильно вытянуты; длина палисадных клеток превышает их ширину в 12—18 раз. Оболочки клеток по всей длине утолщены неравномерно, что вызывает, вероятно, оптический эффект, наблюдаемый при микроскопировании. Этот оптический эффект, основанный на неоднородности структуры оболочки палисадных клеток, проявляется в виде не окрашиваемой красителями светлой линии в верхней части клеток и объясняется разными показателями преломления света по длине световых клеток.
Под слоем палисадного эпидермиса расположены два слоя гиподермальных клеток, подстилаемых тремя-четырьмя слоями тангентально вытянутых темноокрашенных клеток. Эндосперм состоит из крупных тонкостенных паренхиматозных клеток с межклеточниками, он окружает зародыш в виде очень тонкой пленки, состоящей из четырех-пяти рядов бесцветных, часто пустотелых клеток. Из-за быстрого использования эндосперма на рост зародыша основная масса запасных пластичных веществ сосредоточена в его семядолях.
Семядоли зародыша овально-удлиненные с малозаметным жилкованием, мясистые и занимают основной объем семени. Число их обычно равно двум, реже трем. Они с обеих сторон окружены мелкими бесцветными клетками однослойного эпидермиса со слоем кутикулы. С брюшной стороны семядоли под слоем эпидермиса имеется хорошо дифференцированный 3—4-рядный столбчатый мезофилл из вытянутых палисадных клеток. Устьиц на брюшной стороне не имеется, а на спинной они редко рассеяны по всей пластине. В отличие от анатомического строения срединных листьев семядоли имеют два-три ряда столбчатого мезофилла и на спинной стороне, т. е. их строение более однородное (рис. 5).

Рис. 4. Поперечный разрез семенной кожуры:
1 — верхний эпидермис с кутикулой; 2 — световые, или мальпигиевы, клетки столбчатого эпидермиса; 3 катушечные клетки гиподермы; 4 — темнопигментированные тангенталь-но удлиненные клетки внутреннего интегумента с кутикулой; 5 — тонкостенные частично облитерированпые крупные клетки эндосперма; с — световая линия

Рис. 5. Поперечный разрез семядоли зародыша:
1 кутикула; 2 эпидермис брюшной стороны; 3 столбчатый мезофилл; 4 - изодиа-метрические клетки губчатого мезофилла; 5—проводящий пучок с клетками обкладки; в — столбчатый мезофилл спинной стороны
Основную часть семядоли занимают паренхимные клетки губчатого мезофилла с довольно крупными межклетниками.