Широкое распространение не споровых бактерий в зоне корневой системы и их способность использовать разнообразные азотистые соединения позволяют признать их большое значение в превращении азотистых веществ в ризосфере растений, в том числе минерализации органических соединений, биологическом закреплении минеральных соединений азота и т. п. В. В. Михалевой и Н. Б. Лупановой (1964) было показано, что способностью к аммонификации обладают многие представители обширной группы денитрифицирующих бактерий, которые распространены главным образом у корневых систем. Некоторые виды, имеющие соответствующие ферменты, могут вызывать сопряженное течение процессов аммонификации и денитрификации в почвах, содержащих нитраты и богатых органическим веществом. Такие свойства были обнаружены у видов Ps. aurantiaca, Ps. fluorescens, Ps. denitrificans, Ps. radiobacter, Ps. des-molyticum, Bact. agile, Chr. denitrificans, встречающихся в больших количествах на корнях и в ризосфере растений.
Вышесказанное подтверждается и опытом, проведенным Ю. В. Кругловым (1958) с кукурузой. При выращивании этого растения на среде Прянишникова, к которой в качестве единственного источника азота был добавлен пептон, кукуруза не могла развиваться. Когда в эту среду добавили один из широко распространенных на корнях видов денитрифицирующих бактерий Ps. fluorescens, то условия азотного питания кукурузы улучшились. Воздушно-сухой вес растения в варианте без бактерий был 0,45 г, а в присутствии бактерий— 1,33 г.
Наряду с азотом фосфор является одним из важнейших элементов, необходимых для питания растений. Он входит в состав белков нуклеопротеидов клеточных ядер, в состав фитина и лецитина. Фосфорной кислоте принадлежит особо важная роль, так как она участвует в реакциях фосфорилирования, которые заключаются в том, что фосфорная кислота присоединяется к углеводам и промежуточным веществам, образующимся в процессе фотосинтеза, в результате образуются вещества, очень богатые энергией. Распад этих веществ, сопровождающийся выделением энергии, обеспечивает протекание ряда окислительных и синтетических процессов в растениях.
Большая часть фосфора находится в почве в не усвояемых высшими растениями соединениях: это органические соединения фосфора, количество которых доходит до 50% и более от общего его запаса в некоторых почвах, и различные плохо растворимые неорганические соединения, которые в кислых почвах представлены фосфатами алюминия и железа, а в остальных почвах — фосфатами кальция. Фосфор ряда органических и минеральных удобрений (фосфорит, апатит) также недоступен растениям. Некоторая часть содержащихся в этих удобрениях трехкальциевых фосфатов может переходить в растворимое состояние под влиянием кислой реакции почвенного раствора или корневых выделений, однако основная их масса вовлекается в круговорот веществ только в результате деятельности почвенных, ризосферных, прикорневых и корневых микроорганизмов.