Во время заселения молодых, растущих корешков микроорганизмами большое значение имеет характер взаимоотношений между последними. Виды, обладающие антагонистическими свойствами, могут занять преобладающее место в комплексе и этим определить состав корневой микрофлоры.
Имеются данные, которые подтверждают, что образуемые некоторыми почвенными микроорганизмами антибиотические вещества действуют угнетающе на другие. Так, например, на некоторых почвах наблюдалось отсутствие клубеньков на корнях клевера. Причиной этого оказалось наличие в ризосфере большого количества бактерий-антагонистов. Н. А. Красильников (1951) объясняет факт преобладания в ризосфере сравнительно небольшого количества видов при очень большой численности микроорганизмов выделением антибиотических веществ преобладающими видами.
Чтобы выяснить значение антагонизма при заселении микроорганизмами отдельных частей растений, а также установить влияние антагонизма на формирование и состав микробных комплексов корней, был проведен эксперимент с искусственно нанесенными на семена бактериями, обладающими разными свойствами (Ю. М. Возняковская, 1964). Цель состояла в том, чтобы проследить, какие микроорганизмы перейдут с семян на поверхность корней и листьев, какие виды и с какими свойствами «преградят путь» внесенным бактериям для заселения поверхности растений. Семена ржи бактеризовали одним из следующих видов бактерий: 1) Ps. fluorescens — штамм 188, выделенный с корней лядвенца, довольно сильный антагонист ряда культур; 2) Мус. phlei — штамм 171, выделенный с листа проростков ржи, медленно растущий и не обладающий антагонистическими свойствами; 3) Chr. rheni harrisonii — штамм 84, выделенный с корней озимой пшеницы, слабый антагонист.
Затем эти семена высевали в сосуды с почвой в двух повторностях для каждого варианта. Анализировали 12-суточные растения — их надземную часть и корни, отмытые от почвы. В ряде случаев вместо внесенных на семена бактерий на растениях заняли место другие микроорганизмы. При анализе корней обнаруженные культуры (31 вид) были проверены на их взаимоотношения с внесенными видами. Характер заселения разных частей проростков (корней и зеленых частей) представлен на рис. 7.
Оказалось, что в том случае, когда семена бактеризовали культурой 188, обладающей антагонистическими свойствами, она полностью заселила поверхность листьев и в довольно значительном количестве перешла на корни, где она составила около 30% от общего количества микроорганизмов, выросших на чашках при высеве смыва с корней. Наряду с культурой 188 на корни перешли еще 4 вида, из которых 3 оказались ее антагонистами. Они составляли около 50% от общего количества микроорганизмов. Культура 171 хотя и перешла на листья, но в сравнительно небольшом количестве—12%. Из 7 культур, перешедших на листья вместе с культурой 171, 3 оказались антагонистами. На корнях культура 171 не была обнаружена, а из заселивших корни микроорганизмов 45% оказались ее антагонистами. Культура 84 была обнаружена на корнях в очень небольшом количестве— 3%.

Рис. 7. Схема перехода микроорганизмов с семян на растения в зависимости от свойств и присутствия антагонистов. 1 — № 188, выделена с корней лядвенца, антагонист ряда культур, 2— № 171, выделена с листа ржи, не обладает антагонистическими свойствами, 3— № 84, выделена с корней пшеницы, очень слабый антагонист.
Из 9 выделенных с корней культур 3 вида были антагонистами, они составляли 23% от общего количества видов, выросших на чашках бактерий.