Если бы микроорганизмы, даже обладающие полезными свойствами, беспрепятственно размножались на растениях, то это неизбежно привело бы к угнетению последних, а в прикорневой зоне почвы — к конкуренции за питательные вещества. Особенно вредно чрезмерное обилие микрофлоры сказалось бы на растениях в молодом возрасте. Фактически этого не происходит по двум причинам. Поглощаемые растениями элементы пищи расходуются на накопление массы, на рост и т. д., а наружу выделяется лишь небольшая их часть, которая служит пищей для микроорганизмов. Невысокая концентрация питательных веществ как в летучих выделениях растений, так и растворимых в воде, а также наличие у растений приспособлений, защищающих их от возможных при гуттации больших потерь минеральных элементов, — гидатод и мелкоклеточной паренхимы является фактором, ограничивающим размножение микроорганизмов на поверхности растений.
Вторым, не менее значительным фактором, ограничивающим чрезмерное размножение нормальной микрофлоры, является естественный иммунитет растений. Эпифитные микроорганизмы приспособлены к жизни на поверхности растений и не проникают при обычных условиях внутрь их тканей. В настоящее время общепринятым является мнение, что ткани здоровых растений стерильны. Правда, в литературе периодически появлялись работы, в которых приводились факты нахождения бактерий'в разных органах растений (Е. Ф. Березова, 1953; S. Touzig a. L. Bracci-Orsengigo, 1955), однако эти сведения нельзя считать убедительными и окончательно подтвержденными. Еще в 1892 г. Рассел (H. Russel) нашел, что бактерии, искусственно введенные им в стебли растений путем инъекции, в скором времени там погибают. Зодинг (Н. Soding, 1959) изучал выживаемость бактерий в живых листьях. Он помещал мясистые листья алоэ, ириса и других растений в суспензии бактерий и создавал вакуум. После удаления воздуха бактерии из суспензии всасывались путем инфильтрации в клетки листьев. Кроме того, исследовалась судьба бактерий Bact. prodigiosum, Bact. ozaenae, Aero-bacter aerogenes и Ps. fluorescens, введенных в листья при повреждении их поверхности и внесенных в выжатый из этих растений сок. В результате было установлено, что бактерии, введенные в клетки цельного или поврежденного листа, быстро погибают, тогда как в выжатом соке и на поверхности поврежденных листьев они развиваются. О бактерицидное цельных тканей нельзя судить по действию сока, ее можно определить только методом инфильтрации, так как бактерицидность цельной ткани листа зависит от выделения бактерицидных веществ живыми клетками. В частности, Зодингом установлено, что на поверхность стенок межклетников выделяются бактерицидные вещества типа дубильных.
Обнаружено, что из семян многих растений в момент их прорастания выделяются противомикробные вещества. Поэтому если разложить семена на поверхности питательной среды, предварительно засеянной некоторыми микроорганизмами, то вокруг семян образуются зоны отсутствия роста бактерий. Определение природы антибактериальных веществ семян показало, что они относятся к пигментам типа флавонолов и что их действие выражается в блокировке дыхательных систем микроорганизмов (Н. В. Новотельное и И. С. Ежов, 1957). Кроме того, в семенах ржи был найден водорастворимый и термоустойчивый антибиотик, активный против бактерий.